专业净化工程主要是对容易转化为气态而不分解的液态有机化合物及气态样品的分析。仪器设备主要有气相色谱仪，具有计算机控制系统及数据处理系统，自动化程度很高，对有机化合物具有高效的分离能力，所用载气主要有：H2、N2、Ar、He、CO2等。但对高沸点化合物，难挥发的及热不稳定的化合物、离子化合物、高聚物的分离却无能为力。净化工程项目要求局部排风及避免阳光直射在仪器上，避免影响电路系统正常工作的电场及磁场存在，一般设计：仪器台（应离墙以便仪器维修）、万向排气罩、电脑台（一般在仪器台旁配置）、边台、洗涤台、试剂柜等。

专业净化工程系统多，系统小，单独分室控制是实验室净化系统的显著特点。实验室是一系列具有独立功能的实验室，同时使用率不高。如果采用一个大的净化系统，当实验室不同时使用时，能耗大，运行费用高。例如一个面积为1 000m2的万级净化空调系统，每天的电费可高达11 000.00元。结果造成建得起用不起的尴尬后果。净化工程项目为了便于分别控制和成本核算，每个实验室设置一个配电箱，装设独立的电表。控制该系统的风机、空调、照明、插座以及排风风机。系统独立运行，启动关停非常方便。另外实验室净化中，系统小，所用空调和风机都较小，可直接布置在吊顶上部，不需要专门的机房，噪声也在允许范围内。

专业净化工程每种类型的生物安全保护实验室，根据微生物及其所处理毒素的危害程度分为四个级别。各级实验室净化的生物安全防护要求依次为：一级低，四级高。每一实验室净化内都要有三相交流电源和单相交流电源，要设置总电源控制开关，当实验室无人时，应能切断室内电源。净化工程项目室内固定装置的电气设备，例如烤箱，保温箱，冰箱等。如果在实验中使用了这些实验室净化设备，而在实验结时就停止使用的，可连续在该实验室的总电源上；若实验停止后仍须运转的，则应有专用供电电源，不至于因切断实验室的总电源而影响其工作。

专业净化工程由于系统较小，每个房间的面积约为28m2，级别为100,000。根据房间容积和净化水平，系统的送风量为1344m3/h，考虑到过滤器的终阻力，实验室净化系统的系统阻力在600Pa左右。如此小风量大压头的离心风机很难找。净化工程项目空调冷负荷小，冷指标按200W/m2计房间冷负荷仅为5600W。若选用家用空调无法和系统很好连接，而这么小负荷的工业空调根本无法找到。